Quá trình điều tra, xác minh về những sai phạm xảy ra tại Trường THPT Nguyễn Trãi, Cơ quan Cảnh sát điều tra - Công an thành phố Hải Phòng xác định từ tháng 08/2020 đến 08/2021, tại Trường THPT Nguyễn Trãi (địa chỉ: xã An Hưng, huyện An Dương, TP Hải Phòng) xảy ra việc lập khống Hồ sơ thanh toán các hạng mục công trình để rút tiền ngân sách nhà nước, trái với quy định về quản lý tài chính, gây thiệt hại cho ngân sách nhà nước.
Ngày 05/5/2022, Cơ quan Cảnh sát điều tra - Công an thành phố Hải Phòng ra Quyết định khởi tố vụ án hình sự Tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ xảy ra tại Trường THPT Nguyễn Trãi để điều tra, xử lý theo quy định của pháp luật